指甲壳凹凸不平的原因主要有生理性和病理性两类。生理性原因包括过度劳累、营养不良和指甲剪得太短。过度劳累时，大脑负荷加重，睡眠不足，可能导致指甲壳凹凸不平。营养不良，尤其是缺乏钙质、蛋白质等营养元素，也可能引发缺铁性贫血，从而导致指甲凹凸不平。指甲剪得太短也可能导致指甲容易受到细菌或真菌感染，从而出现凹凸不平的情况。

病理性原因包括真菌感染和牛皮癣。真菌感染是导致指甲壳凹凸不平的常见原因之一，平时不注意个人卫生，就可能感染一些真菌，导致指甲凹凸不平。牛皮癣是一种顽固的皮肤疾病，除了会导致皮肤症状之外，也会导致指甲壳凹凸不平，主要表现为指甲上有不规则的深洼。

在了解这些原因后，治疗前应先查明病因，以确保治疗的准确性。如果指甲出现凹凸不平的情况，应及时查明原因并进行治疗。平时应保持良好的个人卫生习惯，避免过度劳累，保证充足的睡眠和营养摄入，以维护身体健康和指甲的健康状态。