是如此复杂，以至于在一些土壤中描述微生物细胞的多样性被认为是不可能的。到目前为止，只有一小部分位于土壤中，土壤上和周围的微生物已被确定为了解其对全球碳循环和其他营养循环的贡献的努力的一部分。土壤也是无数病毒的家园，这些病毒可以感染微生物并影响它们调节这些全球循环的能力。

2018年11月19日，在《自然通讯》上，来自美国能源部(DOE)和基因组研究所(JGI)以及美国能源部科学用户设施办公室的研究人员首次在森林土壤生态系统中发现了巨型病毒基因组。和马萨诸塞大学马斯特分校。顾名思义，巨型病毒的特点是基因组和病毒体不成比例的大，其中含有病毒的遗传物质。

它们通常存在于原生动物和藻类中，因此被认为对其宿主的种群动态和地球的生物地球化学循环有重大影响。

本研究中发现的16种新的巨病毒使巨病毒的系统发育多样性增加了20%以上，属于不同的谱系。例如，一半的新病毒属于Klosneuvirinae，使其成为Mimiviridae中最大的亚科。Schulz和Woyke先前报道说，在废水宏基因组中发现了一组新的巨型病毒，他们称之为Klosneuviruses。

“这些巨型病毒可能在土壤生态系统中被忽视了，但如果你看看主要的衣壳蛋白，它们是条形码或它们的片段，它们无处不在，”JGI微生物项目主任兼该研究的高级作者Tanja Woyke说。哈佛森林中的病毒

这种巨型病毒的基因组是由JGI研究科学家弗雷德里克舒尔茨(Frederik Schulz)发现的，并帮助杰夫布兰查德实验室的UMass Amherst研究生劳伦阿尔特奥(Lauren Alteio)分析了她的宏基因组数据。“与我见过的其他宏基因组数据相比，在这个采样点发现的大量不同的巨型病毒基因组是无与伦比的，”舒尔茨说。这些数据来自Alteio收集的土壤样本，是Blanchard和JGI社区科学项目的一部分。

Blanchard正在从哈佛森林加热和未加热地块收集的土壤中生成参考基因组，这些数据最终将有助于理解微生物温室气体的排放和捕获。Alteio通过美国能源部的SCGSR项目在JGI的Woyke实验室工作了一年。近30年来，马萨诸塞州的哈佛森林一直是世界上持续时间最长的土壤变暖实验的所在地。国家科学基金会长期生态研究(LTER)项目资助，4000英磅。