赛默飞世尔科技有限公司近日公布了一项合作协议的结果,该协议使研究人员能够将高分辨率Orbitrap LC/MS实验的结果与高度规划的生物特异性代谢途径和基因组数据相结合,快速有效地进行基于质谱的小分子研究和分析。
作为成功合作的结果,研究人员现在将Thermo Scientific Compound Discoverer 2.1小分子研究软件平台与SRI International的BioCyc直接连接,后者是9300个数据库的集合,提供关于许多生物的代谢途径和基因组的电子参考资料。在这些途径上自动和交互式叠加统计数据的能力可以促进从代谢组学实验获得的结果的生物学解释。
最后,这一新的链接有望加速化合物发现者用户的数据分析,并使他们能够可视化许多单个化合物的测量结果,以充分了解实验中的生物过程。
今天,代谢组学研究人员可以测量数以千计的小分子,但与对照组相比,要知道哪个细胞系统在研究条件下的表现不同可能具有挑战性,”赛默飞世尔蛋白质基因组学和代谢组学的营销、色谱和质谱总监Andreas Huhmer说。新的集成将允许科学家使用Compound Discoverer自动将检测到的化合物映射到BioCyc代谢途径图上,并将其他实验数据(如相对丰度或差异表达)与该途径联系起来。"
“我们很高兴通过直观易用的系统将BioCyc的强大功能带给赛默飞世尔的客户,”SRI International生物信息学研究组主任Peter Karp说。“科学家现在可以通过从“化合物发现者”到BioCyc代谢途径页面的链接,获得基因组和途径信息的全面知识中心。”